RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.91■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.91■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.91■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H7C4K7 107 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPEF2O14830 753 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D4O60343 1298 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASGR2P07307 311 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASIC1P78348 528 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AMPD3Q01432 767 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POSTNQ15063 836 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPATA1Q5VX52 437 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC8B1Q6J4K2 584 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BEST2Q8NFU1 509 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HPS3Q969F9 1004 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASB7Q9H672 318 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANK1P16157 1881 aa16.9■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TECTAO75443 2155 aa16.89■□□□□ 0.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HOXA9P31269 272 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARPP19P56211 112 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ROR1Q01973 937 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APPL2Q8NEU8 664 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DERAQ9Y315 318 aa16.89■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR27A2RRH5 827 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM221A6NGB7 291 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 M0QZQ0 153 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 M0R296 226 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCL16O15467 120 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CASP1P29466 404 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTMR3Q13615 1198 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF280DQ6N043 979 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF461Q8TAF7 563 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SAAL1Q96ER3 474 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYADMQ96S97 322 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM206Q9H813 350 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C2CD2Q9Y426 696 aa16.88■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XYLBO75191 536 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABLIM3O94929 683 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GARTP22102 1010 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WNT7BP56706 349 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT85P78386 507 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UVSSAQ2YD98 709 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPATA32Q96LK8 384 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNH3Q9ULD8 1083 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POLIQ9UNA4 740 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANO9A1A5B4 782 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLGA8IPA6NC78 632 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL18RAPO95256 599 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POU2F2P09086 479 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AFMP43652 599 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LILRA4P59901 499 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NTHL1P78549 312 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UNC13DQ70J99 1090 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RTL10Q7L3V2 364 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASIC4Q96FT7 647 aa16.86■□□□□ 0.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms