RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGB1	P05556	798 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRPAP1	P30533	357 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPM1A	P35813	382 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TPM4	P67936	248 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBP5	P82980	135 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ENPEP	Q07075	957 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	IQCB1	Q15051	598 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SV2A	Q7L0J3	742 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC35C1	Q96A29	364 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLVAP	Q9BX97	442 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANO9	A1A5B4	782 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIR	O00625	290 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	RB1	P06400	928 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	GTF2H1	P32780	548 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNH2	Q12809	1159 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT39	Q6A163	491 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF214	Q8ND24	703 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	14.76	□□□□□ -0.05	7e-8	■■■■■ 186.3
SELENBP1-208	ENST00000447402	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	SIX4	Q9UIU6	781 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402		I3L4J1	428 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRAPPC3	O43617	180 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TPM2	P07951	284 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIK3CA	P42336	1068 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRCC3	P46736	316 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	MXI1	P50539	228 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYO1E	Q12965	1108 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPM6B	Q13491	265 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	NCOA4	Q13772	614 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZACN	Q401N2	412 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBWD6	Q4V339	395 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP57	Q86XR8	500 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF560	Q96MR9	790 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM161B	Q96MY7	647 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	MARCH5	Q9NX47	278 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	RFXAP	O00287	272 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP1A3	P13637	1013 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	CA8	P35219	290 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	PNPLA4	P41247	253 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	FMO5	P49326	533 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAF6	P49848	677 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	LILRA4	P59901	499 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYL6	P60660	151 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	CETN1	Q12798	172 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAN2A1	Q16706	1144 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	SV2C	Q496J9	727 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	FUT10	Q6P4F1	479 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	HPDL	Q96IR7	371 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS16	Q9H269	839 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	14.75	□□□□□ -0.05	1e-6	■■■■■ 66.8
SELENBP1-208	ENST00000447402	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDH23	Q9H251	3354 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	KPNA7	A9QM74	516 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402		H3BNC9	293 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	VNN1	O95497	513 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	HLA-DRA	P01903	254 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYL7	Q01449	175 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLCB3	Q01970	1234 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT31	Q15323	416 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	VWA3B	Q502W6	1294 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS52	Q8N1B4	723 aa		14.74	□□□□□ -0.05

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