RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 RHOP08100 348 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 TNFSF9P41273 254 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 MYCT1Q8N699 235 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 DDX12PQ92771 950 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 MAFFQ9ULX9 164 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 A0A0B4J269 797 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 OGTO15294 1046 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 LRG1P02750 347 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 ELF1P32519 619 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 GTF2BQ00403 316 aa22.68■■□□□ 1.22
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UBXN4-204ENST00000426921 PTPAQ15257 358 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 KIF12Q96FN5 646 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 GDE1Q9NZC3 331 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.68■■□□□ 1.22
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UBXN4-204ENST00000426921 PRRG1O14668 218 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 SEC24AO95486 1093 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 GPC5P78333 572 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 BEST2Q8NFU1 509 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 LACTBL1A8MY62 500 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 OAZ2O95190 189 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 PTPN2P17706 415 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 DDIT3P35638 169 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 STARD6P59095 220 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 SPAG1Q07617 926 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 ANGPT1Q15389 498 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.66■■□□□ 1.22
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UBXN4-204ENST00000426921 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 STK17AQ9UEE5 414 aa22.66■■□□□ 1.22
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UBXN4-204ENST00000426921 CLIC4Q9Y696 253 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 ECI2O75521 394 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 MICAL2O94851 1124 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 RFX1P22670 979 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 ARPP19P56211 112 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 RESTQ13127 1097 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 SPATA1Q5VX52 437 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 USP49Q70CQ1 688 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 CD302Q8IX05 232 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 ING5Q8WYH8 240 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 EPSTI1Q96J88 318 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 CFAP54Q96N23 3096 aa22.64■■□□□ 1.22
UBXN4-204ENST00000426921 PRR23AA6NEV1 266 aa22.64■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 STK25O00506 426 aa22.64■■□□□ 1.21
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UBXN4-204ENST00000426921 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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UBXN4-204ENST00000426921 PJA1Q8NG27 643 aa22.64■■□□□ 1.21
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UBXN4-204ENST00000426921 KXD1Q9BQD3 176 aa22.64■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.64■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 SYT1P21579 422 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 PAX3P23760 479 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 EPHA5P54756 1037 aa22.63■■□□□ 1.21
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UBXN4-204ENST00000426921 PRKCQQ04759 706 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 HVCN1Q96D96 273 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 CORO1BQ9BR76 489 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 DERAQ9Y315 318 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF197O14709 1029 aa22.62■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 PPP1R37O75864 691 aa22.62■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 CPB1P15086 417 aa22.62■■□□□ 1.21
UBXN4-204ENST00000426921 TYMPP19971 482 aa22.62■■□□□ 1.21
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