RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM130Q8N3G9 435 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 KLHL23Q8NBE8 558 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF576Q9H609 170 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 CBX8Q9HC52 389 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 FANCLQ9NW38 375 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 STK39Q9UEW8 545 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 LZTS1Q9Y250 596 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 NLRC5Q86WI3 1866 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 F8W810 466 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 H3BNC9 293 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 PPEF2O14830 753 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 FGF18O76093 207 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 ITGB1P05556 798 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 UBE3AQ05086 875 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM169Q96HH4 297 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 LRCH3Q96II8 777 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TSPY26PQ9H489 355 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TRANK1O15050 2925 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 PNPLA4P41247 253 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 GCLMP48507 274 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 MXI1P50539 228 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 RBP5P82980 135 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 KRT39Q6A163 491 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF560Q96MR9 790 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 SZT2Q5T011 3432 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 66.8
TSTA3-201ENST00000425753 KCNJ18B7U540 433 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 P4HA2O15460 535 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 VNN1O95497 513 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 LILRA4P59901 499 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 KCNJ12Q14500 433 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 CBWD6Q4V339 395 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 FUT10Q6P4F1 479 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 RABGGTAQ92696 567 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 BECN2A8MW95 431 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TADA2AO75478 443 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 FMO5P49326 533 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TAF6P49848 677 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 KRT17Q04695 432 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 BIRC3Q13489 604 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 MAN2A1Q16706 1144 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 EPOPA6NHQ4 379 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 M0QZQ0 153 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 SPTLC1O15269 473 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TRAPPC3O43617 180 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 SOD2P04179 222 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 ATICP31939 592 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 KCNH2Q12809 1159 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 NCOA4Q13772 614 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 SUSD3Q96L08 255 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 CERS4Q9HA82 394 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-201ENST00000425753 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 KRT19P08727 400 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 GPM6BQ13491 265 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 SV2CQ496J9 727 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 MIIPQ5JXC2 388 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 LUZP1Q86V48 1076 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 GPR65Q8IYL9 337 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 HASPINQ8TF76 798 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-201ENST00000425753 TAF4BQ92750 862 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms