RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.41□□□□□ -0.1
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.41□□□□□ -0.1
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.38□□□□□ -0.11
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM3CQ92520 227 aa14.38□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIPINQ9BVW5 301 aa14.38□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.38□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YIPF1Q9Y548 306 aa14.38□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.38□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCANO14594 1321 aa14.37□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.37□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAD1O00515 517 aa14.37□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJA1P17302 382 aa14.37□□□□□ -0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUCY2CP25092 1073 aa14.37□□□□□ -0.11
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