RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 EHD2Q9NZN4 543 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC151A5D8V7 595 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 KIF4AO95239 1232 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 IQCF3P0C7M6 154 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 GZMAP12544 262 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 RPS6KA3P51812 740 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 OSTNP61366 133 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ITIH3Q06033 890 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 POU5F1BQ06416 359 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CUL2Q13617 745 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 BRD3Q15059 726 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 EEF1DP3Q658K8 133 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF280DQ6N043 979 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 IFNL1Q8IU54 200 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 RHOT2Q8IXI1 618 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SPATA4Q8NEY3 305 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 NLRP7Q8WX94 980 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 MS4A14Q96JA4 679 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SLX1AQ9BQ83 275 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ARFGAP3Q9NP61 516 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF14Q9UBS8 474 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TNFSF13BQ9Y275 285 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNK3O14649 394 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ZEB2O60315 1214 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CPP00450 1065 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CLTAP09496 248 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 MNAT1P51948 309 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 GRIK3Q13003 919 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SLFN11Q7Z7L1 901 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 GIMAP7Q8NHV1 300 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CDT1Q9H211 546 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 FLRT1Q9NZU1 646 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB21Q9UL25 225 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TUBBP07437 444 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC10A3P09131 477 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 HOXC6P09630 235 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM191BP0C7N4 346 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SETSIPP0DME0 302 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CYP2B6P20813 491 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 BPIFB4P59827 614 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 VSNL1P62760 191 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 GPC5P78333 572 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 GPS2Q13227 327 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM187BQ17R55 369 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 C17orf99Q6UX52 265 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TLK2Q86UE8 772 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 AMFRQ9UKV5 643 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 BLOC1S6Q9UL45 172 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.69□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ERLIN1O75477 346 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CALCAP01258 141 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CXCL8P10145 99 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 RGS2P41220 211 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TRPC3Q13507 836 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 IRF5Q13568 498 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CCL14Q16627 93 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC5A9Q2M3M2 681 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 MARCH8Q5T0T0 291 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM270Q6UE05 265 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 NT5DC3Q86UY8 548 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 MMGT1Q8N4V1 131 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SETD4Q9NVD3 440 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 COG5Q9UP83 839 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 PCNTO95613 3336 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 A6NJR5 290 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CES2O00748 559 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ERLIN2O94905 339 aa10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ASS1P00966 412 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CST3P01034 146 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms