RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 NBNO60934 754 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 SELPP16109 830 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 CD302Q8IX05 232 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 CAGE1Q8TC20 777 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.65■■□□□ 1.06
ODC1-202ENST00000405333 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
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ODC1-202ENST00000405333 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 RNF169Q8NCN4 708 aa21.64■■□□□ 1.05
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ODC1-202ENST00000405333 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.64■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 PTGESO14684 152 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 KRT5P13647 590 aa21.63■■□□□ 1.05
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ODC1-202ENST00000405333 TLE2Q04725 743 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 FAAP100Q0VG06 881 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 XKR4Q5GH76 650 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 USP38Q8NB14 1042 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 SYT11Q9BT88 431 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 WEE2P0C1S8 567 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 ASPAP45381 313 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 PALB2Q86YC2 1186 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.63■■□□□ 1.05
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ODC1-202ENST00000405333 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 SQORQ9Y6N5 450 aa21.63■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 ZSCAN12O43309 604 aa21.62■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 LCA5LO95447 670 aa21.62■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 ITGA4P13612 1032 aa21.62■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 RAP1GAPP47736 663 aa21.62■■□□□ 1.05
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ODC1-202ENST00000405333 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.62■■□□□ 1.05
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ODC1-202ENST00000405333 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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ODC1-202ENST00000405333 BFSP2Q13515 415 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 TCTN1Q2MV58 587 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 HPDLQ96IR7 371 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 MIOSQ9NXC5 875 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.059e-40■■■■■ 41.2
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ODC1-202ENST00000405333 CCL23P55773 120 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 SLC18A3Q16572 532 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 TAF3Q5VWG9 929 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 SDCBP2Q9H190 292 aa21.61■■□□□ 1.05
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ODC1-202ENST00000405333 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.61■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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ODC1-202ENST00000405333 PITPNM1O00562 1244 aa21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 RBP5P82980 135 aa21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 TMEM270Q6UE05 265 aa21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 UBR7Q8N806 425 aa21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 HIPK3Q9H422 1215 aa21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.6■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 ZNF623O75123 536 aa21.59■■□□□ 1.05
ODC1-202ENST00000405333 CYP11B1P15538 503 aa21.59■■□□□ 1.05
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