RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 POLD4Q9HCU8 107 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 BAG5Q9UL15 447 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRN2O75325 713 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GSTM1P09488 218 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ALDH1A3P47895 512 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 IL1RL1Q01638 556 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RHAGQ02094 409 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TAP1Q03518 808 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE3CQ15386 1083 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GRIK5Q16478 980 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PAOXQ6QHF9 649 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 KDELC1Q6UW63 502 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 UCMAQ8WVF2 138 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRN2Q92932 1015 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 IQCDQ96DY2 449 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SELENONQ9NZV5 590 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 F8W810 466 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP5HO75947 161 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CDH3P22223 829 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GRK2P25098 689 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RPIAP49247 311 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 IST1P53990 364 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 NLRP5P59047 1200 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CUL4AQ13619 759 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPK6Q16659 721 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 FUT11Q495W5 492 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HAPLN3Q96S86 360 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PNKPQ96T60 521 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MENTQ9BUN1 341 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CRB1P82279 1406 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WWV3 80 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC3O43617 180 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE5AO76074 875 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 FKBP9O95302 570 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTS2O95450 1211 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPN3P20807 821 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ASMTP46597 345 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SCNN1GP51170 649 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SNTA1Q13424 505 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RASIP1Q5U651 963 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HAUS8Q9BT25 410 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PALMDQ9NP74 551 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL2O95198 593 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 IL10P22301 178 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PMLP29590 882 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CASP9P55211 416 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL35Q6PF15 583 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 BORAQ6PGQ7 559 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF366Q8N895 744 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ATL1Q8WXF7 558 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 NTMT1Q9BV86 223 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF38Q9H0F5 515 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms