RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 GNRH1P01148 92 aa29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 ASGR1P07306 291 aa29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 TUBB4BP68371 445 aa29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 GPC5P78333 572 aa29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 RHOT2Q8IXI1 618 aa29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 C2CD2Q9Y426 696 aa29.34■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 CITO14578 2027 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 FTCDO95954 541 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 ITGB3P05106 788 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 ELF2Q15723 593 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 KCNA10Q16322 511 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 SMYD5Q6GMV2 418 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 CAGE1Q8TC20 777 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 TMEM40Q8WWA1 233 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 TLR10Q9BXR5 811 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 XYLT2Q9H1B5 865 aa29.33■■■□□ 2.29
MSRB2-201ENST00000376510 NCK2O43639 380 aa29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 GNA15P30679 374 aa29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 VEGFBP49765 207 aa29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF667Q5HYK9 610 aa29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 MEI1Q5TIA1 1274 aa29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 KLHDC9Q8NEP7 349 aa29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CAPZA3Q96KX2 299 aa29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 OSBPL9Q96SU4 736 aa29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 SNTG2Q9NY99 539 aa29.32■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ATICP31939 592 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGEF6Q15052 776 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 TEX35Q5T0J7 233 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ACAD10Q6JQN1 1059 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 KIF12Q96FN5 646 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 FAXDC2Q96IV6 333 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 SIX4Q9UIU6 781 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 FAM170AA1A519 330 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CST5P28325 142 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGEF26Q96DR7 871 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CISHQ9NSE2 258 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ITGA11Q9UKX5 1188 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 DERAQ9Y315 318 aa29.31■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CALCAP01258 141 aa29.3■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 TFRCP02786 760 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CD58P19256 250 aa29.3■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 DAAM2Q86T65 1068 aa29.3■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 UBR7Q8N806 425 aa29.3■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 DPP3Q9NY33 737 aa29.3■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 TRIM72Q6ZMU5 477 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 RNF180Q86T96 592 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 LRRC57Q8N9N7 239 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 PXYLP1Q8TE99 480 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 OSGEPQ9NPF4 335 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 TRPV2Q9Y5S1 764 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF185O15231 689 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 THAP12O43422 761 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 P4HA1P13674 534 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 RBP5P82980 135 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 WDR72Q3MJ13 1102 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD7Q92527 254 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 AGAP1Q9UPQ3 857 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CDY2AQ9Y6F7 541 aa29.29■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 WEE2P0C1S8 567 aa29.28■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ASPAP45381 313 aa29.28■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 RPS6KA1Q15418 735 aa29.28■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 PEX26Q7Z412 305 aa29.28■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 PSMB7Q99436 277 aa29.28■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF132P52740 706 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 TCEAL1Q15170 157 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC181Q5TID7 509 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 SLFN11Q7Z7L1 901 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 SESTD1Q86VW0 696 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 RABGGTAQ92696 567 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 SNX27Q96L92 541 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 POLIQ9UNA4 740 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CXCR5P32302 372 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 HADHBP55084 474 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 SERINC5Q86VE9 423 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF653Q96CK0 615 aa29.27■■■□□ 2.28
MSRB2-201ENST00000376510 HPDLQ96IR7 371 aa29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms