RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373209.2

PRF1-201, Transcript of perforin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRF1, Length 2,492 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1-201ENST00000373209 CUL2Q13617 745 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 GNPTABQ3T906 1256 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 USP37Q86T82 979 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 PORCNQ9H237 461 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 LRRC19Q9H756 370 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 THAP12O43422 761 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 KIAA0754O94854 1291 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 KRT10P13645 584 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 CAPSQ13938 189 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 LRRC14Q15048 493 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 KAZNQ674X7 775 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 HOOK3Q86VS8 718 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 MGARPQ8TDB4 240 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 ADAM22Q9P0K1 906 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 MCM3APO60318 1980 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 NFASCO94856 1347 aa16.09■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 GGPS1O95749 300 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 ITGA8P53708 1063 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 OSTNP61366 133 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 NOMO3P69849 1222 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 NOP14P78316 857 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 CENPCQ03188 943 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 BTBD7Q9P203 1132 aa16.08■□□□□ 0.17
PRF1-201ENST00000373209 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 RPS12P25398 132 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 IVDP26440 423 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 CLDN10P78369 228 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 CALCOCO2Q13137 446 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 MAMLD1Q13495 774 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 STXBP2Q15833 593 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 KYNUQ16719 465 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 LY6KQ17RY6 165 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 LRRC71Q8N4P6 559 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 MORC4Q8TE76 937 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 CEP89Q96ST8 783 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.08■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 BRCA2P51587 3418 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 FNTAP49354 379 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 DCLK3Q9C098 648 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 RASGRF2O14827 1237 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 RARGP13631 454 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 ARL2P36404 184 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 RTP1P59025 263 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 TGFB2P61812 414 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 CLUL1Q15846 466 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 HAUS1Q96CS2 278 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 TCHPQ9BT92 498 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 TBK1Q9UHD2 729 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 EVPLQ92817 2033 aa16.07■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 WDR90Q96KV7 1748 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 A0A0B4J269 797 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 CLTAP09496 248 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 FDX1P10109 184 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 DRD4P21917 467 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 MMP13P45452 471 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 ORC1Q13415 861 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 NCOA4Q13772 614 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 C12orf42Q96LP6 360 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 FZD9O00144 591 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 DNM1LO00429 736 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 PROSCO94903 275 aa16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PRF1-201ENST00000373209 PGK2P07205 417 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms