RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363172.2

U3.48-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 216 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.48-201ENST00000363172 SIGLEC6O43699 453 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CD8BP10966 210 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 SRFP11831 508 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ITGA4P13612 1032 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 NOVP48745 357 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 UBE2HP62256 183 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ME3Q16798 604 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 NEK1Q96PY6 1258 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 PANK2Q9BZ23 570 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CPVLQ9H3G5 476 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CHST7Q9NS84 486 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 FAM50BQ9Y247 325 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 INSL6Q9Y581 213 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 LAMA4Q16363 1823 aa8.33□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ABCB11O95342 1321 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 EMSYQ7Z589 1322 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 PPM1BO75688 479 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CSPG5O95196 566 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 F2P00734 622 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CPA1P15085 419 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CD247P20963 164 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 THPOP40225 353 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 HAND2P61296 217 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ZP2Q05996 745 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 GPM6BQ13491 265 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 PLCL1Q15111 1095 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 STXBP2Q15833 593 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CLUL1Q15846 466 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 EPC2Q52LR7 807 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 HS1BP3Q53T59 392 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 RPAINQ86UA6 219 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 NEK9Q8TD19 979 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 SAMD11Q96NU1 681 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 YME1L1Q96TA2 773 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 GP6Q9HCN6 339 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CLDND1Q9NY35 253 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 COL20A1Q9P218 1284 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 MTMR6Q9Y217 621 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 COL4A6Q14031 1691 aa8.32□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 MYO7AQ13402 2215 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 SHISA3A0PJX4 238 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 LARGE1O95461 756 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 PRAMEF1O95521 474 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 SNHG28P0DPA3 235 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CTNNB1P35222 781 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CD96P40200 585 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 PPTC7Q8NI37 304 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 RMDN3Q96TC7 470 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 KCNH6Q9H252 994 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 WHRNQ9P202 907 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 KIF3AQ9Y496 699 aa8.31□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 NEDD4P46934 1319 aa8.3□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 SYCE3A1L190 88 aa8.3□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.3□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.3□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 H3BNC9 293 aa8.3□□□□□ -1.08
U3.48-201ENST00000363172 HAS3O00219 553 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms