RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 KRT17Q04695 432 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TMED1Q13445 227 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ADA2Q9NZK5 511 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV5-2P06315 115 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SREBF2Q12772 1141 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EMC2Q15006 297 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 BATF3Q9NR55 127 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KIF28PB7ZC32 967 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FBXW4P57775 412 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 AFF2P51816 1311 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MYO1CO00159 1063 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CARD9Q9H257 536 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GID8Q9NWU2 228 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EXTL3O43909 919 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ADCY1Q08828 1119 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF7Q14155 803 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DDIASQ8IXT1 998 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 M0R3G1 203 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DFFAO00273 331 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ANXA9O76027 345 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KBTBD13C9JR72 458 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RGL2O15211 777 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF543Q08ER8 600 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TAGAPQ8N103 731 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 POLE3Q9NRF9 147 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ADORA2BP29275 332 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GPRASP2Q96D09 838 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TCHHQ07283 1943 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NCAM2O15394 837 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EGFRP00533 1210 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RXRGP48443 463 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 BOLA3Q53S33 107 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 C12orf60Q5U649 245 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 POLIQ9UNA4 740 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TLR2O60603 784 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 C4BPBP20851 252 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PRDX5P30044 214 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FDFT1P37268 417 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GRIK1P39086 918 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RANBP1P43487 201 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NAB2Q15742 525 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SAAL1Q96ER3 474 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ABHD8Q96I13 439 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DYDC2Q96IM9 177 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DPP7Q9UHL4 492 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ITM2BQ9Y287 266 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MYH6P13533 1939 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GH1P01241 217 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MYL2P10916 166 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CPB1P15086 417 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SKOR1P84550 965 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SLC7A5Q01650 507 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KCNA1Q09470 495 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TTC26A0AVF1 554 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 WDR91A4D1P6 747 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ODC1P11926 461 aa6.3□□□□□ -1.4
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