RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 Q4G0T1 1027 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 STKLD1Q8NE28 680 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 INTUQ9ULD6 942 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP9BO43861 1147 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP5HO75947 161 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ARP10275 920 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT35Q92764 455 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SALL3Q9BXA9 1300 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 UPP2O95045 317 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP2C8P10632 490 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ITIH2P19823 946 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 MTHFD1LQ6UB35 978 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF26Q96DR7 871 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXP3Q9BZS1 431 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM15Q9C019 465 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 RSAD1Q9HA92 442 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 HACD3Q9P035 362 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PRRG1O14668 218 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2H1P32780 548 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1G1P47890 313 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDCD3Q8IVD9 361 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ATPAF2Q8N5M1 289 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 OSBPL8Q9BZF1 889 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 KBTBD4Q9NVX7 518 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TMCC1O94876 653 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP2K2P36507 400 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 RAD9BQ6WBX8 426 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R42Q7RTR8 314 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 EGFL8Q99944 293 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL11Q9NVR0 708 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TADA3O75528 432 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GARTP22102 1010 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PPME1Q9Y570 386 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 MGEA5O60502 916 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 IMPG1Q17R60 797 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 DNERQ8NFT8 737 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX19Q92543 992 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 AGXT2Q9BYV1 514 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 13.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SMAPO00193 183 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 APRTP07741 180 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMB3Q13751 1172 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC1Q9BTT6 524 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB6BQ9NRW1 208 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF3C4Q9UKN8 822 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM200BP0CF97 657 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SHMT1P34896 483 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 MORF4L2Q15014 288 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 UGP2Q16851 508 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 C3orf67Q6ZVT6 689 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 VWDEQ8N2E2 1590 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXL16Q8N461 479 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 BTBD6Q96KE9 485 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPC7Q9HCX4 862 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 CXCL11O14625 94 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGB3P05106 788 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GPD1P21695 349 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNA8P32881 189 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 CUL2Q13617 745 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf19Q8IY42 314 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 IDI2Q9BXS1 227 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PXMP2Q9NR77 195 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHB8Q9UN66 801 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 DEPDC5O75140 1603 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 NTRK3Q16288 839 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 MGAT5BQ3V5L5 792 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC30AQ86WT1 665 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PI4K2AQ9BTU6 479 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 NDFIP2Q9NV92 336 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 HPSEQ9Y251 543 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GMNCA6NCL1 334 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR182O15218 404 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 COMTP21964 271 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PDK1Q15118 436 aa17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms