RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 CSADQ9Y600 493 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 O00370 1275 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 EBAG9O00559 213 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFAB1O14561 156 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM167AQ96KS9 214 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 CHST7Q9NS84 486 aa22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 GRM1Q13255 1194 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MAMLD1Q13495 774 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR49Q8IV35 697 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 CAND2O75155 1236 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 LGR5O75473 907 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 TOM1L1O75674 476 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 PAEPP09466 180 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 EFNA5P52803 228 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 DENND2CQ68D51 928 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 HOOK3Q86VS8 718 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM50Q86XT4 487 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR20Q99678 358 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 PSTPIP1O43586 416 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 SEC24CP53992 1094 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 TAS2R40P59535 323 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT17Q04695 432 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 LIN9Q5TKA1 542 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 IER5Q5VY09 327 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 DCLK3Q9C098 648 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 THAP12O43422 761 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 AP3M2P53677 418 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 NLRP14Q86W24 1093 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC125Q86Z20 511 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MARK3P27448 753 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC29A2Q14542 456 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBTB33Q86T24 672 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 PGM2Q96G03 612 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 ELP3Q9H9T3 547 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 AAASQ9NRG9 546 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 WHRNQ9P202 907 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 RIPK2O43353 540 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 PRKCBP05771 671 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 RARGP13631 454 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 FGFR4P22455 802 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 IVDP26440 423 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 TMOD1P28289 359 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 MCL1Q07820 350 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 PTK6Q13882 451 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 OTUD5Q96G74 571 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 AZI2Q9H6S1 392 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
KCNQ1-202ENST00000335475 OGTO15294 1046 aa22.08■■□□□ 1.12
KCNQ1-202ENST00000335475 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
KCNQ1-202ENST00000335475 MAN1A1P33908 653 aa22.08■■□□□ 1.12
KCNQ1-202ENST00000335475 SLMAPQ14BN4 828 aa22.08■■□□□ 1.12
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1R7Q15435 360 aa22.08■■□□□ 1.12
KCNQ1-202ENST00000335475 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.08■■□□□ 1.12
KCNQ1-202ENST00000335475 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms