RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 VSTM1Q6UX27 236 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 YY1AP1Q9H869 796 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 GGT7Q9UJ14 662 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 THAP12O43422 761 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 PRKG1Q13976 671 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 SNX3O60493 162 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 RALAP11233 206 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 OAZ1P54368 228 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 SP2Q02086 613 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 IFT74Q96LB3 600 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 ACAD9Q9H845 621 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 RLFQ13129 1914 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-201ENST00000308020 DOCK1Q14185 1865 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.161e-5■■■■□ 25.7
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PTDSS2-201ENST00000308020 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC1A1P43005 524 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 CEP57Q86XR8 500 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 PASD1Q8IV76 773 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 ATL2Q8NHH9 583 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 TBK1Q9UHD2 729 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 GH1P01241 217 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 MAN1A1P33908 653 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 WNT7BP56706 349 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 MPP2Q14168 576 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 GNPTABQ3T906 1256 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 CYP4X1Q8N118 509 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 GDAP1Q8TB36 358 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM143Q96AN5 459 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM81BQ96LP2 452 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 PEX10O60683 326 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 GJC1P36383 396 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 LIG4P49917 911 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 CDHR1Q96JP9 859 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 C19orf81C9J6K1 198 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 MGRN1O60291 552 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 PROSCO94903 275 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 GSTA1P08263 222 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 MYBL1P10243 752 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 TNNI1P19237 187 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 TAS2R40P59535 323 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 FSTL1Q12841 308 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC63Q8NA47 563 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 C12orf42Q96LP6 360 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 FZD9O00144 591 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 CETPP11597 493 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 BRAFP15056 766 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 GARTP22102 1010 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP5DP30049 168 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 MAP2K2P36507 400 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 ACOT2P49753 483 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 CENPCQ03188 943 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 ADCY1Q08828 1119 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR44Q5JSH3 913 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2-201ENST00000308020 MON1BQ7L1V2 547 aa22.3■■□□□ 1.16
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