RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACAP1Q15027 740 aa15.57■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC89Q8N998 374 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATL2Q8NHH9 583 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.57■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.57■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.56■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 EBF3Q9H4W6 596 aa15.56■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC13A1Q9BZW2 595 aa15.56■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.55■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.55■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT34O76011 436 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDE5AO76074 875 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANPEPP15144 967 aa15.54■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MYBPC3Q14896 1274 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 SBK1Q52WX2 424 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.54■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM136AQ96C01 138 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZWILCHQ9H900 591 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT82Q9NSB4 513 aa15.54■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
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CCNDBP1-201ENST00000300213 VAV1P15498 845 aa15.54■□□□□ 0.08
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