RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ADM5C9JUS6 153 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SLC26A4O43511 780 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 TNFSF9P41273 254 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ITIH3Q06033 890 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 FAM47CQ5HY64 1035 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF354CQ86Y25 554 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SCFD2Q8WU76 684 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 FAM49BQ9NUQ9 324 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 KCNG1Q9UIX4 513 aa13.31□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 PTGER2P43116 358 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 NEDD9Q14511 834 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 IQCKQ8N0W5 287 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 OR6B3Q8NGW1 331 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 PLEKHO2Q8TD55 490 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 PYROXD1Q8WU10 500 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 LRRN4Q8WUT4 740 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 GLRA4Q5JXX5 417 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 GPRASP2Q96D09 838 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CFAP36Q96G28 342 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SNF8Q96H20 258 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SCINQ9Y6U3 715 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ADSSP30520 456 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC6Q16204 474 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 FAXCQ5TGI0 409 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ATL2Q8NHH9 583 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 HES6Q96HZ4 224 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SEC16BQ96JE7 1060 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SMC6Q96SB8 1091 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 HESX1Q9UBX0 185 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 DCTN4Q9UJW0 460 aa13.3□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM120BA0PK00 339 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 KRT3P12035 628 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ANXA13P27216 316 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CORO7P57737 925 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 TFDP1Q14186 410 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 KDM7AQ6ZMT4 941 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 LRRC34Q8IZ02 419 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 HVCN1Q96D96 273 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 HAUS2Q9NVX0 235 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 AGAP1Q9UPQ3 857 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 UMODL1Q5DID0 1318 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 TJP3O95049 919 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ETS1P14921 441 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 EZRP15311 586 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SAT1P21673 171 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 IREB2P48200 963 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 GTF2BQ00403 316 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 MAP4K3Q8IVH8 894 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 KLHL29Q96CT2 875 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 DSG3P32926 999 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 DRP2Q13474 957 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 NME8Q8N427 588 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 KIF2BQ8N4N8 673 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 PARVAQ9NVD7 372 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 STRCQ7RTU9 1775 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 TIAM2Q8IVF5 1701 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SUN1O94901 812 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 JAM2P57087 298 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 SESN3P58005 492 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 MCOLN2Q8IZK6 566 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.29□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 F8VP50 259 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 P4HA2O15460 535 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 VTNP04004 478 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 PDGFRBP09619 1106 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 NOVP48745 357 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 HSD17B4P51659 736 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 RNF34Q969K3 372 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CPB2Q96IY4 423 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 MMP19Q99542 508 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 MCF2LO15068 1137 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CST8O60676 142 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 FAM107AO95990 144 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CXCL8P10145 99 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 CDH6P55285 790 aa13.28□□□□□ -0.28
UBXN4-201ENST00000272638 FSTL1Q12841 308 aa13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms