RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 CNTD2Q9H8S5 307 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 POTEB3A0JP26 581 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 PI4KAP2A4QPH2 592 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 F8W8V4 182 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 FGF18O76093 207 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 FUCA1P04066 466 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 BCAT1P54687 386 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 VWA3BQ502W6 1294 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 MUM1L1Q5H9M0 696 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 POTEBQ6S5H4 581 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ANKS4BQ8N8V4 417 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ZFPM2Q8WW38 1151 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 FANCD2OSQ96PS1 177 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CTAGE1Q96RT6 745 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 RMND1Q9NWS8 449 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 GULP1Q9UBP9 304 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 FBXL5Q9UKA1 691 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 DENND2AQ9ULE3 1009 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa3.96□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.784e-7■■■□□ 18.9
LATS1-201ENST00000253339 RAB27BO00194 218 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 HSF2BPO75031 334 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 KCNA6P17658 529 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ALDH3A1P30838 453 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CUX1P39880 1505 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CPA2P48052 419 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 KCNQ4P56696 695 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 PHC1P78364 1004 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 SLC13A2Q13183 592 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 STX1AQ16623 288 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 FHOD3Q2V2M9 1422 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CROCCP2Q86T23 111 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 NEK11Q8NG66 645 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ISL2Q96A47 359 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ZNF711Q9Y462 761 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ARHGAP6O43182 974 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 SRGAP3O43295 1099 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 STX6O43752 255 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ACTL6BO94805 426 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 GGPS1O95749 300 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CST3P01034 146 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 TGFB3P10600 412 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 SELPP16109 830 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 PRKAA2P54646 552 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 FMO1Q01740 532 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 GRIN1Q05586 938 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ACAD11Q709F0 780 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 AACSQ86V21 672 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 NLRP14Q86W24 1093 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 OR8H3Q8N146 312 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 KRT222Q8N1A0 295 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 TTC39CQ8N584 583 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 OR6B3Q8NGW1 331 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CPT1CQ8TCG5 803 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 EPC1Q9H2F5 836 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 SERHLQ9NQF3 203 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 AP5S1Q9NUS5 200 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 TBK1Q9UHD2 729 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 NAGPAQ9UK23 515 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 ADAMTS8Q9UP79 889 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 PEX12O00623 359 aa3.95□□□□□ -1.78
LATS1-201ENST00000253339 NPHS1O60500 1241 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms