RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF699Q32M78 642 aa20.62■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 DPP3Q9NY33 737 aa20.62■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 CNTN3Q9P232 1028 aa20.62■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.62■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 SCN5AQ14524 2016 aa20.62■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 ZBTB6Q15916 424 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 FANCGO15287 622 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 KRT5P13647 590 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 DSC3Q14574 896 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 ARMC5Q96C12 935 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.61■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 ASPAP45381 313 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 RAP1GAPP47736 663 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 GPNMBQ14956 572 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 SLC18A3Q16572 532 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 ADAM2Q99965 735 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 PTGESO14684 152 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 WEE2P0C1S8 567 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 TAF3Q5VWG9 929 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 CHST12Q9NRB3 414 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 DYNC1I1O14576 645 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 CAND2O75155 1236 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 UQCRHP07919 91 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 CHRNB2P17787 502 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 CD58P19256 250 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 SPA17Q15506 151 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 PTPN14Q15678 1187 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 XKR4Q5GH76 650 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 CD302Q8IX05 232 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 UBR7Q8N806 425 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 RNF169Q8NCN4 708 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 SDCBP2Q9H190 292 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 NENFQ9UMX5 172 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 TNNT1P13805 278 aa20.58■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 MLH1P40692 756 aa20.58■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.58■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.58■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 KIAA1328Q86T90 577 aa20.58■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.58■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.58■□□□□ 0.89
DUSP1-201ENST00000239223 CCP110O43303 1012 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 NBNO60934 754 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 VAV2P52735 878 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 CDH8P55286 799 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 KRT83P78385 493 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 TRIM60Q495X7 471 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM270Q6UE05 265 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 GAD1Q99259 594 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 MIOSQ9NXC5 875 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 NAGPAQ9UK23 515 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 COL6A1P12109 1028 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 KCNE1P15382 129 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 CYP11B1P15538 503 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 SELPP16109 830 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 MAGEA1P43355 309 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 CAGE1Q8TC20 777 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 HPDLQ96IR7 371 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP1-201ENST00000239223 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms