RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	LDB18	Q07887	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	MRS1	P07266	363 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	MET2	P08465	486 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	MRPS28	P21771	286 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	OAC1	P32332	324 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	GPX2	P38143	162 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YBR285W	P38354	144 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	ECM14	P38836	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	BXI1	P48558	297 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	MRX11	Q03079	207 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	REP1	P03871	373 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SCO1	P23833	295 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	PDC2	P32896	925 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	FRE2	P36033	711 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YBR242W	P38331	238 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	FAR7	P43592	221 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YNR048W	P53740	393 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	COS1	P53822	381 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	DML1	Q03652	475 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	TAF9	Q05027	157 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SEI1	Q06058	285 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	MDM32	Q12171	622 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	MHT1	Q12525	324 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RIB3	Q99258	208 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	EXO1	P39875	702 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	EGT2	P42835	1041 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YJR015W	P47090	510 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RFM1	Q12192	310 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RTR2	Q12378	196 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SPS100	P13130	326 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	CAP2	P13517	287 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	CDC50	P25656	391 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	COQ3	P27680	312 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	MEP2	P41948	499 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YGR017W	P53210	297 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SWS2	P53937	143 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SAE3	P89114	91 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SPG4	Q04438	115 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	DIC1	Q06143	298 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	COQ10	Q08058	207 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	THI20	Q08224	551 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	ATP14	Q12349	124 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	TKL2	P33315	681 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	SRY1	P36007	326 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YBR137W	P38276	179 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RFC2	P40348	353 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	PGD1	P40356	397 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	HAC1	P41546	238 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YJL043W	P47053	257 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	VPS25	P47142	202 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	TPN1	P53099	579 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	BOR1	P53838	576 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	PEX30	Q06169	523 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	MCT1	Q12283	360 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YCR100C	P25606	316 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YBL010C	P32788	280 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	MRPL39	P36533	70 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	DOG2	P38773	246 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	DOG1	P38774	246 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	VMA7	P39111	118 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	ERV46	P39727	415 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	AVT2	P39981	480 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	AIM25	P47140	327 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	COQ5	P49017	307 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMD8	YML038C	YNL184C	P53876	108 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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