RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	HLR1	Q04429	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	RKI1	Q12189	258 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MSW1	P04803	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	UTR5	P32630	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YHR177W	P38867	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	FLO5	P38894	1075 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	IKS1	P47042	667 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	BOR1	P53838	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	APJ1	P53940	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PIN3	Q06449	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	EMP70	P32802	667 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	COQ5	P49017	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CTS2	Q06350	511 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CDD1	Q06549	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	NDD1	Q08887	554 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ODC2	Q99297	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YUH1	P35127	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CBP4	P37267	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MIX23	P38162	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	REG2	P38232	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SPC25	P40014	221 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CIN2	P46670	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ELP6	Q04868	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	COX19	Q3E731	98 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CYC7	P00045	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
RGT1	YKL038W	MKK2	P32491	506 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PAU5	P43575	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	VPS25	P47142	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YNL092W	P53934	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CRZ1	P53968	678 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PER33	Q12144	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ICT1	Q12385	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	DOG1	P38774	246 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	TRR2	P38816	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	NIT1	P40447	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CAB5	Q03941	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	URK1	P27515	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MLF3	P32047	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MDL1	P33310	695 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	TIR2	P33890	251 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	HSP10	P38910	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YIL060W	P40519	144 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	GTS1	P40956	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YIP4	P53093	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ATG4	P53867	494 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YNL140C	P53910	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ELC1	Q03071	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ATP10	P18496	279 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	THI2	P38141	450 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YER121W	P40076	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	BIT61	P47041	543 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MET14	Q02196	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ECM18	Q04623	453 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MRX8	Q05473	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CTR3	Q06686	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ECM29	P38737	1868 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	CDC21	P06785	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PDE1	P22434	369 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	POP8	P38208	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PAU12	P53343	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	RDR1	Q08904	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MRS4	P23500	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YGR066C	P53242	292 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PAU23	Q07987	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	COQ10	Q08058	207 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PAU17	Q12370	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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