RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	AGPAT1	Q99943	283 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		15.19	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF286B	P0CG31	522 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	OAZ1	P54368	228 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RPS6KA2	Q15349	733 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ATP8B3	O60423	1300 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	GYPC	P04921	128 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCGF5	Q86SE9	256 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DNER	Q8NFT8	737 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	GPRASP2	Q96D09	838 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CFAP36	Q96G28	342 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997		A0A1B0GUA9	196 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FGB	P02675	491 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DNAJB2	P25686	324 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCDC151	A5D8V7	595 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CDH6	P55285	790 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02	2e-6	■■□□□ 12.2
NEDD4L-238	ENST00000635997	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TC2N	Q8N9U0	490 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MS4A14	Q96JA4	679 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CALB1	P05937	261 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SRL	Q86TD4	932 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PXMP2	Q9NR77	195 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RNF19A	Q9NV58	838 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RNF14	Q9UBS8	474 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TJP3	O95049	919 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NPTXR	O95502	500 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	HMBS	P08397	361 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	KRT3	P12035	628 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	NPTX2	P47972	431 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	UBA3	Q8TBC4	463 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAF2	Q96CS3	445 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	AMACR	Q9UHK6	382 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		15.17	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPFIA4	O75335	1185 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SKI	P12755	728 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MSH2	P43246	934 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	BCAR1	P56945	870 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RBP5	P82980	135 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CASP8	Q14790	479 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	C18orf8	Q96DM3	657 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TBX20	Q9UMR3	447 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	UROD	P06132	367 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PORCN	Q9H237	461 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DPP7	Q9UHL4	492 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PSEN2	P49810	448 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MFSD10	Q14728	455 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RFFL	Q8WZ73	363 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	STK33	Q9BYT3	514 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	UNCX	A6NJT0	531 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	EML1	O00423	815 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ATP8B1	O43520	1251 aa		15.16	■□□□□ 0.02

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