RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 IPPQ9Y573 584 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 RECQL4O94761 1208 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 GFPT2O94808 682 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ASS1P00966 412 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CD52P31358 61 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM132DQ14C87 1099 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ACRBPQ8NEB7 543 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SHC3Q92529 594 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 HAUS4Q9H6D7 363 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 DERAQ9Y315 318 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 EVI5O60447 810 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CD4P01730 458 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 PAK2Q13177 524 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SPOPLQ6IQ16 392 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CAGE1Q8TC20 777 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTN3Q9P232 1028 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 LCA5LO95447 670 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF11P52732 1056 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL6P60660 151 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 NOP14P78316 857 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPC3Q13507 836 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CXorf38Q8TB03 319 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 IMPG2Q9BZV3 1241 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL16Q9H2A7 254 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF39Q9H2S5 420 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 DEF6Q9H4E7 631 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SIX4Q9UIU6 781 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 NUB1Q9Y5A7 615 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC172P0C7W6 258 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 AKAP5P24588 427 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 PTK2Q05397 1052 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 XKR4Q5GH76 650 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM71AQ8IYT1 594 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF12Q96FN5 646 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 APOL6Q9BWW8 343 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM105AQ9NUU6 356 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 AKR1B10O60218 316 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 DSC3Q14574 896 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB6Q15916 424 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 JAKMIP2Q96AA8 810 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIP11Q15643 1979 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF263O14978 683 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT83P78385 493 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 CUL2Q13617 745 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 MBTPS1Q14703 1052 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF4BQ92750 862 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN18Q96SJ8 248 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 PARP2Q9UGN5 583 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGB3P05106 788 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ANXA13P27216 316 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ARID3AQ99856 593 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 DPP3Q9NY33 737 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGA11Q9UKX5 1188 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 UMODL1Q5DID0 1318 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 MGEA5O60502 916 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT19P08727 400 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNE1P15382 129 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 BFSP2Q13515 415 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM130Q8N3G9 435 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SYT11Q9BT88 431 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 COL6A1P12109 1028 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SELPP16109 830 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCN1P35523 988 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SPA17Q15506 151 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC18A3Q16572 532 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF699Q32M78 642 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 VRTNQ9H8Y1 702 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 KLK14Q9P0G3 267 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF623O75123 536 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ACO1P21399 889 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms