RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	CXCL8	P10145	99 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	GAP43	P17677	238 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	STAT6	P42226	847 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	BRCC3	P46736	316 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF131	P52739	623 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTPN5	P54829	565 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARPP19	P56211	112 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	REST	Q13127	1097 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF280D	Q6N043	979 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP37	Q86T82	979 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ELMOD1	Q8N336	334 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	EPSTI1	Q96J88	318 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCNK12	Q9HB15	430 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197		I3L4J1	428 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	STK25	O00506	426 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCL16	O15467	120 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	IDE	P14735	1019 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	PAX3	P23760	479 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	NUBP1	P53384	320 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRIN1	Q05586	938 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	POSTN	Q15063	836 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADAL	Q6DHV7	355 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	DYM	Q7RTS9	669 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	BEST2	Q8NFU1	509 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	HVCN1	Q96D96	273 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASIC4	Q96FT7	647 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABLIM1	O14639	778 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	PIGR	P01833	764 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	POU2F2	P09086	479 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPB1	P15086	417 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP3A5	P20815	502 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	AVPR2	P30518	371 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALCAM	Q13740	583 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTPA	Q15257	358 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTSS1L	Q765P7	747 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	FLCN	Q8NFG4	579 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCNN1	Q92952	543 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SUSD3	Q96L08	255 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDH7	Q9ULB5	785 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A0B4J269	797 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADAM12	O43184	909 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	LAMP2	P13473	410 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTF2B	Q00403	316 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	AMPD3	Q01432	767 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ROR1	Q01973	937 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPAG1	Q07617	926 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	IQCE	Q6IPM2	695 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	DDX12P	Q92771	950 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNX21	Q969T3	373 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACCS	Q96QU6	501 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYADM	Q96S97	322 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NPIPB4-222	ENST00000614197	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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