RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-240ENST00000613995 UBA7P41226 1012 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ATP11AP98196 1134 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CDC42EP1Q00587 391 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 GRIN1Q05586 938 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 PKP1Q13835 747 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 BECN1Q14457 450 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 STK38Q15208 465 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 SPECC1Q5M775 1068 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ODR4Q5SWX8 454 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 SPRED2Q7Z698 418 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CABP7Q86V35 215 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF410Q86VK4 478 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 RNF149Q8NC42 400 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 RNF169Q8NCN4 708 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ARNTL2Q8WYA1 636 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 USP28Q96RU2 1077 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 FAM129BQ96TA1 746 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 YME1L1Q96TA2 773 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 RAD9AQ99638 391 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ADAM2Q99965 735 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 DNM3Q9UQ16 869 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 PPME1Q9Y570 386 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 SQORQ9Y6N5 450 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 EYSQ5T1H1 3165 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 LRRIQ4A6NIV6 560 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 FAM229AH3BQW9 127 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 RFXAPO00287 272 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 EREGO14944 169 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ASAP2O43150 1006 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 F13A1P00488 732 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 LIG1P18858 919 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CYP11B2P19099 503 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 MUTP22033 750 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 GLRA2P23416 452 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ARL2P36404 184 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 LONP1P36776 959 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 GATMP50440 423 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 TAP1Q03518 808 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 GRB10Q13322 594 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 TFDP1Q14186 410 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 KARSQ15046 597 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 PTPAQ15257 358 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 LONRF3Q496Y0 759 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 KCNK18Q7Z418 384 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 MCPH1Q8NEM0 835 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 MYLIPQ8WY64 445 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 TOP1MTQ969P6 601 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CALML4Q96GE6 196 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 AK8Q96MA6 479 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 GUCD1Q96NT3 240 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CLIC6Q96NY7 704 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 RUSC1Q9BVN2 902 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CSRNP2Q9H175 543 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 RASSF4Q9H2L5 321 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 MINDY3Q9H8M7 445 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 INSL6Q9Y581 213 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 COL4A6Q14031 1691 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4DIP-240ENST00000613995 CCDC169A6NNP5 214 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms