RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599231.5

STRN4-217, Transcript of striatin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STRN4, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4-217ENST00000599231 MLH1P40692 756 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 PIK3CAP42336 1068 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 GUCY2FP51841 1108 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 NEK11Q8NG66 645 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 ZFP42Q96MM3 310 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.65□□□□□ -0.06
STRN4-217ENST00000599231 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.063e-8■■□□□ 12.6
STRN4-217ENST00000599231 PTPRSQ13332 1948 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PTGESO14684 152 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PHACTR2O75167 634 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 FAM189BP81408 668 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CETN1Q12798 172 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TRIM14Q14142 442 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 FIGNQ5HY92 759 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 MFSD5Q6N075 450 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PGBD4Q96DM1 585 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GAD1Q99259 594 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.079e-9■■■■■ 111.8
STRN4-217ENST00000599231 RAB20Q9NX57 234 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.64□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ARL5CA6NH57 179 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ENPP3O14638 875 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CSF2RAP15509 400 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 LRMPQ12912 555 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NCOA4Q13772 614 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ARID5BQ14865 1188 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ZBTB6Q15916 424 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GJB7Q6PEY0 223 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CXorf38Q8TB03 319 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NUP58Q9BVL2 599 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 RSAD1Q9HA92 442 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 SIX4Q9UIU6 781 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.63□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 COL4A6Q14031 1691 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 A0A1W2PQJ5 194 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 MFAP3LO75121 409 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ITGB3P05106 788 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CASP14P31944 242 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 SCNN1GP51170 649 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TTC3P53804 2025 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 MYL6P60660 151 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 IQCEQ6IPM2 695 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TMEM199Q8N511 208 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 BEST2Q8NFU1 509 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 IQCDQ96DY2 449 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 DPP3Q9NY33 737 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CEP72Q9P209 647 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 INPPL1O15357 1258 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms