RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 HELQQ8TDG4 1101 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 SQORQ9Y6N5 450 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRN2O75325 713 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT5P13647 590 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 NOP14P78316 857 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CUL2Q13617 745 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 NAB2Q15742 525 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAI1Q9UI46 699 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 LACTBL1A8MY62 500 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PJA2O43164 708 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SKIP12755 728 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 TERF1P54274 439 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 RBP5P82980 135 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF699Q32M78 642 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 BEST2Q8NFU1 509 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM58Q8NG06 486 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 AGPAT1Q99943 283 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 NIF3L1Q9GZT8 377 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CTAGE9A4FU28 777 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ASS1P00966 412 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 THPOP40225 353 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO1EQ12965 1108 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 VNN1O95497 513 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT19P08727 400 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 H2AFZP0C0S5 128 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB27AP51159 221 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP27A1Q02318 531 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 HIC1Q14526 733 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.29■■□□□ 1.48
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CAPNS1-212ENST00000591041 H2AFVQ71UI9 128 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF12Q96FN5 646 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 NOX5Q96PH1 765 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 NAGPAQ9UK23 515 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CD4P01730 458 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 FGFR4P22455 802 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CAP1Q01518 475 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 JADE1Q6IE81 842 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP120Q8N960 986 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR88Q9GZN0 384 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PHF24Q9UPV7 400 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.28■■□□□ 1.48
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CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087X0T9 212 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 DNM1LO00429 736 aa24.27■■□□□ 1.48
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CAPNS1-212ENST00000591041 LHX8Q68G74 356 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
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CAPNS1-212ENST00000591041 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRJQ12913 1337 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP25P42331 645 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CDR2Q01850 454 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM26DQ5JW98 314 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM11Q96F44 468 aa24.26■■□□□ 1.47
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