RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRG1O14668 218 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D4O60343 1298 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN2P17706 415 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC10P48553 1259 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ARPP19P56211 112 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS36Q5K4E3 855 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM134Q9H6X4 195 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 HEBP1Q9NRV9 189 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A7Q9NVC3 462 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 DMXL1Q9Y485 3027 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 HIP1RO75146 1068 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC24AO95486 1093 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 FCARP24071 287 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ELF1P32519 619 aa28.1■■■□□ 2.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN23Q96B33 292 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ELSPBP1Q96BH3 223 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEAL4Q96EI5 215 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CORO1BQ9BR76 489 aa28.1■■■□□ 2.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4F11Q9HBI6 524 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PATJQ8NI35 1801 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PP2D1A8MPX8 630 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SYN3O14994 580 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ATF2P15336 505 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNE1P15382 129 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PROZP22891 400 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK7Q13164 816 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 KMT5AQ9NQR1 393 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTN3Q9P232 1028 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL5Q9UKA1 691 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 SPTLC1O15269 473 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC24BO95487 1268 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MCF2P10911 925 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CCR2P41597 374 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 FZD5Q13467 585 aa28.08■■■□□ 2.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 TCEAL8Q8IYN2 117 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAP3Q96P50 834 aa28.08■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa28.08■■■□□ 2.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 NUB1Q9Y5A7 615 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C4K7 107 aa28.06■■■□□ 2.08
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CAPNS1-211ENST00000590874 CTXN3Q4LDR2 81 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RINT1Q6NUQ1 792 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK18Q7Z418 384 aa28.06■■■□□ 2.08
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
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CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf186Q6ZWK4 172 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ATRIPQ8WXE1 791 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NELL1Q92832 810 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SUSD3Q96L08 255 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB34Q9BZG1 259 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP14Q9HCL3 533 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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