RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 CD8BP10966 210 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TSHRP16473 764 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKCAP17252 672 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DDIT3P35638 169 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TECP42680 631 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HK3P52790 923 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ICA1Q05084 483 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PPFIA1Q13136 1202 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DACT2Q5SW24 774 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 BICRALQ6AI39 1079 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MZT2AQ6P582 158 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNT18Q6P9A2 607 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SPRED2Q7Z698 418 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC7BQ86TV6 843 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC51AQ86UW1 340 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DRC7Q8IY82 874 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TMTC2Q8N394 836 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF152Q8N8N0 203 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKS4BQ8N8V4 417 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NETO2Q8NC67 525 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM63Q969Q1 353 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SHISA4Q96DD7 197 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MISP3Q96FF7 219 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RRN3Q9NYV6 651 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MSH6P52701 1360 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS12O14924 1447 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MST1RQ04912 1400 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NCAPD2Q15021 1401 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf167Q5SNV9 1468 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SCN11AQ9UI33 1791 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQJ5 194 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS3O15072 1205 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MAFGO15525 162 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 OPHN1O60890 802 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TGFB1P01137 390 aa4.86□□□□□ -1.63
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CAPNS1-210ENST00000590211 GPR15P49685 360 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FMO1Q01740 532 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MGAT2Q10469 447 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NOGQ13253 232 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 IKZF1Q13422 519 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 BLMHQ13867 455 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DOC2BQ14184 412 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 BECN1Q14457 450 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NOMO1Q15155 1222 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NR0B2Q15466 257 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC14A2Q15849 920 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TIGD5Q53EQ6 642 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CABP7Q86V35 215 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 IP6K1Q92551 441 aa4.86□□□□□ -1.63
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CAPNS1-210ENST00000590211 NEUROD6Q96NK8 337 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DMRTA2Q96SC8 542 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R16BQ96T49 567 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 AMNQ9BXJ7 453 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 STK31Q9BXU1 1019 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 WASF3Q9UPY6 502 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0A6YYJ9 748 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 F8W8V4 182 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BUI4 141 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO1FO00160 1098 aa4.85□□□□□ -1.63
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