RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PROZP22891 400 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EFNA5P52803 228 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FANCCQ00597 558 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC63Q05C16 580 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 POU5F1BQ06416 359 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP3CAQ08209 521 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PAK2Q13177 524 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 BFSP2Q13515 415 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DSC3Q14574 896 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT31Q15323 416 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM187BQ17R55 369 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ZPBP2Q6X784 338 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RPAINQ86UA6 219 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GPD1LQ8N335 351 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RABGGTAQ92696 567 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 BADQ92934 168 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM2Q99965 735 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 THAP9Q9H5L6 903 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DMAC2Q9NW81 257 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNKQ9P0W0 207 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PARP2Q9UGN5 583 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 IPPQ9Y573 584 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TET1Q8NFU7 2136 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 HTTP42858 3142 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GUA9 196 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LACTBL1A8MY62 500 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 N4BP3O15049 544 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0355O15063 1070 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 OGTO15294 1046 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDN3O15551 220 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RECQL4O94761 1208 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SERPINC1P01008 464 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 NFICP08651 508 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 STAG3L1P0CL83 205 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R2P41236 205 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GCLMP48507 274 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MCL1Q07820 350 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP24A1Q07973 514 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RBL2Q08999 1139 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MIIPQ5JXC2 388 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 NOTUMQ6P988 496 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CAGE1Q8TC20 777 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 BORCS6Q96GS4 357 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TOX2Q96NM4 488 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MIOSQ9NXC5 875 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRSQ13332 1948 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ENPP3O14638 875 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PPEF2O14830 753 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR182O15218 404 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 B4GALT3O60512 393 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ADCY5O95622 1261 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMP1P01033 207 aa6.54□□□□□ -1.36
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