RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 SPOPLQ6IQ16 392 aa28.04■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 NT5DC4Q86YG4 428 aa28.04■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 C1orf127Q8N9H9 656 aa28.04■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 CXorf38Q8TB03 319 aa28.04■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 SHC3Q92529 594 aa28.04■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 HAUS4Q9H6D7 363 aa28.04■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 SIX4Q9UIU6 781 aa28.04■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 IPPQ9Y573 584 aa28.04■■■□□ 2.08
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SCAMP4-210ENST00000588555 SGPL1O95470 568 aa28.02■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 CD4P01730 458 aa28.02■■■□□ 2.08
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SCAMP4-210ENST00000588555 FMNL3Q8IVF7 1028 aa28.02■■■□□ 2.08
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SCAMP4-210ENST00000588555 CNTN3Q9P232 1028 aa28.02■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 NUB1Q9Y5A7 615 aa28.02■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF263O14978 683 aa28.01■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 CCP110O43303 1012 aa28.01■■■□□ 2.08
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SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM130Q8N3G9 435 aa28.01■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 USP38Q8NB14 1042 aa28.01■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
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SCAMP4-210ENST00000588555 DERAQ9Y315 318 aa28.01■■■□□ 2.08
SCAMP4-210ENST00000588555 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
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SCAMP4-210ENST00000588555 MBTPS1Q14703 1052 aa28.01■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 XKR4Q5GH76 650 aa28.01■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
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SCAMP4-210ENST00000588555 DSC3Q14574 896 aa28■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB6Q15916 424 aa28■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 OLIG1Q8TAK6 271 aa28■■■□□ 2.07
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SCAMP4-210ENST00000588555 A0A0U1RQJ8 604 aa27.99■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 AKR1B10O60218 316 aa27.99■■■□□ 2.07
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SCAMP4-210ENST00000588555 COL6A1P12109 1028 aa27.96■■■□□ 2.07
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SCAMP4-210ENST00000588555 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa27.96■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 TSPAN18Q96SJ8 248 aa27.96■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 NIF3L1Q9GZT8 377 aa27.96■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 VRTNQ9H8Y1 702 aa27.96■■■□□ 2.07
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa27.96■■■□□ 2.07
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