RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579272.5

TRIM16-215, Transcript of tripartite motif containing 16, human

TSL 4

Gene TRIM16, Length 568 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM16-215	ENST00000579272	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CDT1	Q9H211	546 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CEP83	Q9Y592	693 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CIT	O14578	2027 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272		A0A0U1RQJ8	604 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ABLIM1	O14639	778 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ENC1	O14682	589 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	MED7	O43513	233 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	BUB1	O43683	1085 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CLSTN1	O94985	981 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	MYL3	P08590	195 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	STAG3L1	P0CL83	205 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CYP2C19	P33261	490 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	GRM5	P41594	1212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	PSMC4	P43686	418 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	GJA9	P57773	515 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	DAAM2	Q86T65	1068 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	HACE1	Q8IYU2	909 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	SETD4	Q9NVD3	440 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ANK1	P16157	1881 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	PCNT	O95613	3336 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	FANCG	O15287	622 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	SEPT4	O43236	478 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	SGPL1	O95470	568 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	VNN1	O95497	513 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	VTN	P04004	478 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	RARB	P10826	455 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	APLP1	P51693	650 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	RBP5	P82980	135 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	SP3	Q02447	781 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	MYO1E	Q12965	1108 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ELF2	Q15723	593 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	AMHR2	Q16671	573 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	TATDN2	Q93075	761 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	TLR10	Q9BXR5	811 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	MIS12	Q9H081	205 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CCDC188	H7C350	402 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	TSPAN1	O60635	241 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CABYR	O75952	493 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	KIF4A	O95239	1232 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	CYP1A2	P05177	515 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	PAEP	P09466	180 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRIM16-215	ENST00000579272	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71

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