RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCANO14594 1321 aa31.25■■■□□ 2.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PALMO75781 387 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLSTN1O94985 981 aa31.25■■■□□ 2.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TAF4BQ92750 862 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACAP3Q96P50 834 aa31.25■■■□□ 2.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF699Q32M78 642 aa31.21■■■□□ 2.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C2CD2Q9Y426 696 aa31.21■■■□□ 2.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RHOT2Q8IXI1 618 aa31.2■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 SYCE1Q8N0S2 351 aa31.2■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBR7Q8N806 425 aa31.2■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa31.2■■■□□ 2.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM132DQ14C87 1099 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCEAL1Q15170 157 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 MEI1Q5TIA1 1274 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM270Q6UE05 265 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTAGE6Q86UF2 777 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTAGE4Q8IX94 777 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD7Q92527 254 aa31.19■■■□□ 2.58
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