RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 ADRB1P08588 477 aa20.07■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 CCR2P41597 374 aa20.07■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 TXKP42681 527 aa20.07■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 UPP1Q16831 310 aa20.07■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.07■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 MTMR9Q96QG7 549 aa20.07■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 ST3GAL1Q11201 340 aa20.06■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 SEC24AO95486 1093 aa20.05■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 PTPN2P17706 415 aa20.05■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 ATP2B1P20020 1258 aa20.05■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.05■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.05■□□□□ 0.8
INO80E-212ENST00000568043 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.05■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 MED24O75448 989 aa20.04■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.04■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 VITQ6UXI7 678 aa20.04■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 CHD6Q8TD26 2715 aa20.04■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 GUCY1B3Q02153 619 aa20.02■□□□□ 0.8
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INO80E-212ENST00000568043 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.01■□□□□ 0.79
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INO80E-212ENST00000568043 ARNTLO00327 626 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-212ENST00000568043 PRRG1O14668 218 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-212ENST00000568043 GDF9O60383 454 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-212ENST00000568043 MICAL2O94851 1124 aa20■□□□□ 0.79
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INO80E-212ENST00000568043 GJA1P17302 382 aa20■□□□□ 0.79
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