RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 CYP27A1Q02318 531 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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CTU2-208ENST00000566637 MTFR1Q15390 333 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 SLC18A3Q16572 532 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 UBXN11Q5T124 520 aa22.14■■□□□ 1.14
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CTU2-208ENST00000566637 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 SNX27Q96L92 541 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 APOL6Q9BWW8 343 aa22.14■■□□□ 1.14
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CTU2-208ENST00000566637 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 CHST12Q9NRB3 414 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-208ENST00000566637 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.13■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 KIF12Q96FN5 646 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.13■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 ZNF699Q32M78 642 aa22.13■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 HACE1Q8IYU2 909 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 TAF4BQ92750 862 aa22.13■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 ZNF263O14978 683 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 RECQL4O94761 1208 aa22.12■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 KRT5P13647 590 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 PARP2Q9UGN5 583 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 HES2Q9Y543 173 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 IPPQ9Y573 584 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 KRT86O43790 486 aa22.11■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 GHRP10912 638 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 CYP26A1O43174 497 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 FAM228BP0C875 321 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 AGPAT1Q99943 283 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 AKAP5P24588 427 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 CD52P31358 61 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 ATICP31939 592 aa22.09■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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CTU2-208ENST00000566637 GNG11P61952 73 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-208ENST00000566637 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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