RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CIT	O14578	2027 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	PAPLN	O95428	1278 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CXCL8	P10145	99 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	PLCG1	P19174	1290 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	HOXA9	P31269	272 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	SPAG1	Q07617	926 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	MCM6	Q14566	821 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	UVSSA	Q2YD98	709 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CDH7	Q9ULB5	785 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966		H7C4K7	107 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	PRRG1	O14668	218 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	PDC	P20941	246 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	NCKAP1L	P55160	1127 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	GRIN1	Q05586	938 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	PARVG	Q9HBI0	331 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	SYN3	O14994	580 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	LRG1	P02750	347 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	SRF	P11831	508 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	ROR1	Q01973	937 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	MCL1	Q07820	350 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	HTR4	Q13639	388 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	RAD54L	Q92698	747 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF12	Q96FN5	646 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	WNT16	Q9UBV4	365 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CLTA	P09496	248 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	AOC1	P19801	751 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	ITFG1	Q8TB96	612 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR152	Q8TDT2	470 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	FGF13	Q92913	245 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM212A	Q96EL1	285 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	TBX20	Q9UMR3	447 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	PI15	O43692	258 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	TRAK2	O60296	914 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	NPR3	P17342	541 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	APPL2	Q8NEU8	664 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	ING5	Q8WYH8	240 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	ANHX	E9PGG2	379 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	SPECC1	Q5M775	1068 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF280D	Q6N043	979 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	PARM1	Q6UWI2	310 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	MTSS1L	Q765P7	747 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC15	Q8TF66	581 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	CLIC4	Q9Y696	253 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	WDR27	A2RRH5	827 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	TNFSF9	P41273	254 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	CUL4A	Q13619	759 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	KYAT1	Q16773	422 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	RTL10	Q7L3V2	364 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	FGF14	Q92915	247 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	SUSD3	Q96L08	255 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	KRBA1	A5PL33	1030 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	CPB1	P15086	417 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX12P	Q92771	950 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	OGT	O15294	1046 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	GFRA3	O60609	400 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	RHO	P08100	348 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	POU2F2	P09086	479 aa		27.58	■■■□□ 2.01

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