RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 C9IYK1 514 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 F8W810 466 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PDXKO00764 312 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PTGESO14684 152 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ARHGEF15O94989 841 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC192P0DO97 292 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 CXCL8P10145 99 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 NR2F2P24468 414 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 AKAP5P24588 427 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PTGIRP43119 386 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 EFNA5P52803 228 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SMTNP53814 917 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 OSTNP61366 133 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PAK2Q13177 524 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 BFSP2Q13515 415 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 NAB2Q15742 525 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 NFIL3Q16649 462 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 MFSD5Q6N075 450 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ZPBP2Q6X784 338 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 CXorf38Q8TB03 319 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ZFP42Q96MM3 310 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ADAM2Q99965 735 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 TSPY26PQ9H489 355 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ANO10Q9NW15 660 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SNTG2Q9NY99 539 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 IPPQ9Y573 584 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PATJQ8NI35 1801 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ENPP3O14638 875 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 TOM1L1O75674 476 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 RECQL4O94761 1208 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 TRIM49P0CI25 452 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 TRIM49CP0CI26 452 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF165P49910 485 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 LIG4P49917 911 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 GUCY2FP51841 1108 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 APBA1Q02410 837 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ALCAMQ13740 583 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 MIIPQ5JXC2 388 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 RSPH3Q86UC2 560 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 BICD1Q96G01 975 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 MSTO1Q9BUK6 570 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 KLK14Q9P0G3 267 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 SQORQ9Y6N5 450 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 MYH10P35580 1976 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 OBSL1O75147 1896 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1W2PRU2 124 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 TTC26A0AVF1 554 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 FSD2A1L4K1 749 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PSMA7O14818 248 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PPEF2O14830 753 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 PRMT3O60678 531 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 NFICP08651 508 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 LINC00271P0C7V0 271 aa9.03□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 STAG3L1P0CL83 205 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms