RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.75■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 TTC28Q96AY4 2481 aa22.75■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 UBE4BO95155 1302 aa22.75■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 TEX28O15482 410 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 NFICP08651 508 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 KLRC2P26717 231 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 CEP57Q86XR8 500 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 GPR65Q8IYL9 337 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 CASP10Q92851 521 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 TTPALQ9BTX7 342 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.74■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.74■■□□□ 1.23
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TMOD3-203ENST00000558455 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 I3L4J1 428 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 IL9P15248 144 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 EPCAMP16422 314 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 BRCC3P46736 316 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 GUCY2FP51841 1108 aa22.73■■□□□ 1.23
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TMOD3-203ENST00000558455 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 ASB7Q9H672 318 aa22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 MBTPS2O43462 519 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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TMOD3-203ENST00000558455 ADH1AP07327 375 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 CYP3A5P20815 502 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 LRPAP1P30533 357 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 CLCN4P51793 760 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 DPYDQ12882 1025 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 STK4Q13043 487 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 DERAQ9Y315 318 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.72■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 TGFB1I1O43294 461 aa22.71■■□□□ 1.23
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TMOD3-203ENST00000558455 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.71■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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TMOD3-203ENST00000558455 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.71■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.71■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.71■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 BEST2Q8NFU1 509 aa22.71■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 FAM50BQ9Y247 325 aa22.71■■□□□ 1.23
TMOD3-203ENST00000558455 C2CD2Q9Y426 696 aa22.71■■□□□ 1.23
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TMOD3-203ENST00000558455 IL18RAPO95256 599 aa22.7■■□□□ 1.22
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TMOD3-203ENST00000558455 PSMD2Q13200 908 aa22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 PSMD5Q16401 504 aa22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 KANK3Q6NY19 840 aa22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 GPD1LQ8N335 351 aa22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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TMOD3-203ENST00000558455 APOL5Q9BWW9 433 aa22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 FNIP2Q9P278 1114 aa22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 MCM4P33991 863 aa22.69■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.69■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.69■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 FBXL18Q96ME1 805 aa22.69■■□□□ 1.22
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