RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	MYMK	A6NI61	221 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PODXL	O00592	558 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SPTLC2	O15270	562 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TBC1D4	O60343	1298 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	RFPL2	O75678	378 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	LRPAP1	P30533	357 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ATL3	Q6DD88	541 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CEP57	Q86XR8	500 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	DDX12P	Q92771	950 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	STAM	Q92783	540 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	BICD1	Q96G01	975 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SUSD3	Q96L08	255 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137		A0A087X0B3	334 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TMEM221	A6NGB7	291 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137		M0R296	226 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ADAM12	O43184	909 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SPATA31D3	P0C874	917 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CXCL8	P10145	99 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PAX3	P23760	479 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MTMR3	Q13615	1198 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	STK38	Q15208	465 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SEZ6	Q53EL9	994 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SFR1	Q86XK3	245 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ASIC4	Q96FT7	647 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CUEDC2	Q9H467	287 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ASB7	Q9H672	318 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	DERA	Q9Y315	318 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CACNA1H	O95180	2353 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	LACTBL1	A8MY62	500 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137		M0QZQ0	153 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CUTA	O60888	179 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ABLIM3	O94929	683 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	F13A1	P00488	732 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	OR1D2	P34982	312 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TNFSF9	P41273	254 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	BRCC3	P46736	316 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ALCAM	Q13740	583 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	POSTN	Q15063	836 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	E2F4	Q16254	413 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SPATA1	Q5VX52	437 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	DYM	Q7RTS9	669 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	APPL2	Q8NEU8	664 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	NXPE3	Q969Y0	559 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MAFF	Q9ULX9	164 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CLUH	O75153	1309 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137		H7C4K7	107 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137		I3L4J1	428 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	OAZ2	O95190	189 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	C8A	P07357	584 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ADSS	P30520	456 aa		12.49	□□□□□ -0.41

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