RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CTSHP09668 335 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CCDC181Q5TID7 509 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 JADE1Q6IE81 842 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CPA5Q8WXQ8 436 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TLR10Q9BXR5 811 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SNX12Q9UMY4 172 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ARID2Q68CP9 1835 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NPTXRO95502 500 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ALDH1A1P00352 501 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TNNC2P02585 160 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ITGB3P05106 788 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CFHP08603 1231 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CHRNB2P17787 502 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 FMO1Q01740 532 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ORC1Q13415 861 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ZNF699Q32M78 642 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 DPH6Q7L8W6 267 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CEP112Q8N8E3 955 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SYT11Q9BT88 431 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 COL1A2P08123 1366 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ANO9A1A5B4 782 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 GPR32O75388 356 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CLTAP09496 248 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 RARBP10826 455 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 AKAP5P24588 427 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CDH8P55286 799 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 GOLGA1Q92805 767 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ACAP3Q96P50 834 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SPC25Q9HBM1 224 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SNTG2Q9NY99 539 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 MYH10P35580 1976 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GUA9 196 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 KCNK3O14649 394 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 RAP1GAPP47736 663 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CDR1P51861 262 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CDR2Q01850 454 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PEX26Q7Z412 305 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 KCNN1Q92952 543 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 BTBD6Q96KE9 485 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ADAMTS10Q9H324 1103 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 KLK14Q9P0G3 267 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 POLIQ9UNA4 740 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ANKRD62A6NC57 917 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 THAP12O43422 761 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 ZMYND10O75800 440 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 ASS1P00966 412 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 CYBAP13498 195 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 GNA15P30679 374 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 POU5F1BQ06416 359 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 C2orf54Q08AI8 447 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 NAA35Q5VZE5 725 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 ZNF410Q86VK4 478 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-215ENST00000549143 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms