RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549101.1

USP15-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-211ENST00000549101 PTPAQ15257 358 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-211ENST00000549101 TMEM240Q5SV17 173 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-211ENST00000549101 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-211ENST00000549101 Q6ZPA2 131 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-211ENST00000549101 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-211ENST00000549101 FITM2Q8N6M3 262 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-211ENST00000549101 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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USP15-211ENST00000549101 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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USP15-211ENST00000549101 CFIP05156 583 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 HLA-DOAP06340 250 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 RAB39AQ14964 217 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 CDHR4A6H8M9 788 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 IL33O95760 270 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 OCA2Q04671 838 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 CEP89Q96ST8 783 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 PRRX2Q99811 253 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 USP25Q9UHP3 1055 aa7.25□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 HSD11B2P80365 405 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 GUCY1B3Q02153 619 aa7.24□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 ABLIM3O94929 683 aa7.23□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 SPDEFO95238 335 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 GPANK1O95872 356 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 CD1AP06126 327 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 MALP21145 153 aa7.23□□□□□ -1.25
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USP15-211ENST00000549101 SLFN5Q08AF3 891 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 SNAPC2Q13487 334 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 TP53BP2Q13625 1128 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 CHFRQ96EP1 664 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 TTPALQ9BTX7 342 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 FOXN1O15353 648 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 SLC43A1O75387 559 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 CDKL5O76039 1030 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 PF4V1P10720 104 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
USP15-211ENST00000549101 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
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