RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 YARSP54577 528 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 MCM6Q14566 821 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 PPM1LQ5SGD2 360 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC39A4Q6P5W5 647 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 PARM1Q6UWI2 310 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKS3Q6ZW76 656 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 RTL10Q7L3V2 364 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC7A14Q8TBB6 771 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 FGF13Q92913 245 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 FGF14Q92915 247 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC38A7Q9NVC3 462 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 CDH7Q9ULB5 785 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 CLIC4Q9Y696 253 aa12.91□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ARHGEF37A1IGU5 675 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR27A2RRH5 827 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SYN3O14994 580 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 CLDN3O15551 220 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAPPC3O43617 180 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SEC24AO95486 1093 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 PIGRP01833 764 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 CFHP08603 1231 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SRFP11831 508 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 HARSP12081 509 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 PLCG1P19174 1290 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 LONP1P36776 959 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 UBA7P41226 1012 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 TNFSF9P41273 254 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ROR1Q01973 937 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SPAG1Q07617 926 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 STRN3Q13033 797 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 BRAPQ7Z569 592 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SIX5Q8N196 739 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 RAD54LQ92698 747 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 EPSTI1Q96J88 318 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SUSD3Q96L08 255 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ODF2LQ9ULJ1 636 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 TBX20Q9UMR3 447 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 NUMBLQ9Y6R0 609 aa12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CLSTN3-211ENST00000541667 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 VPS13AQ96RL7 3174 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0B4J269 797 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 LACTBL1A8MY62 500 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PROB1E7EW31 1015 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 VNN2O95498 520 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CLTAP09496 248 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CXCL8P10145 99 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ATF2P15336 505 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 LRPAP1P30533 357 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 DDIT3P35638 169 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 GTF2BQ00403 316 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 RESTQ13127 1097 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 LIN9Q5TKA1 542 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 GPBP1Q86WP2 473 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 FLCNQ8NFG4 579 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR152Q8TDT2 470 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 DDX12PQ92771 950 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 STRA6Q9BX79 667 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 FBXL5Q9UKA1 691 aa12.89□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD63C9JTQ0 380 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 M0QZQ0 153 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAK2O60296 914 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 BMP15O95972 392 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SYT1P21579 422 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 NMT1P30419 496 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 GPC5P78333 572 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SPECC1Q5M775 1068 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 NPAS3Q8IXF0 933 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC105Q8IYK2 499 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MYCT1Q8N699 235 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CALML4Q96GE6 196 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 IKZF4Q9H2S9 585 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MFSD1Q9H3U5 465 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms