RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538566.6

TMIGD1-202, Transcript of transmembrane and immunoglobulin domain containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMIGD1, Length 1,124 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1-202ENST00000538566 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 B3GALT6Q96L58 329 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ZNF558Q96NG5 402 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 UBN1Q9NPG3 1134 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 MTMR10Q9NXD2 777 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 LHX6Q9UPM6 363 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 BRWD1Q9NSI6 2320 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CITO14578 2027 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ANK1P16157 1881 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 NLRC5Q86WI3 1866 aa10.02□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TRANK1O15050 2925 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 C5orf67F2Z3F1 127 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 EXOC3O60645 756 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 FGF18O76093 207 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 THP07101 528 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 LAG3P18627 525 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 NR2F2P24468 414 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CCNE1P24864 410 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 BRCC3P46736 316 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CLCNKBP51801 687 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 NLRP12P59046 1061 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ERVFC1P60507 584 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PPP2R3AQ06190 1150 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TUSC3Q13454 348 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CEP135Q66GS9 1140 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 SLC9A9Q8IVB4 645 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CXorf38Q8TB03 319 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ZNF516Q92618 1163 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 IGSF21Q96ID5 467 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 GPR62Q9BZJ7 368 aa10.01□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ZNF233A6NK53 670 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 H3BNC9 293 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PODXLO00592 558 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 SPTLC1O15269 473 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CALUO43852 315 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 LRRN2O75325 713 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 EFEMP2O95967 443 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TRIM49P0CI25 452 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TRIM49CP0CI26 452 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ADAM9Q13443 819 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TMEM132DQ14C87 1099 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PSMD6Q15008 389 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 C1orf127Q8N9H9 656 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 POF1BQ8WVV4 589 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 BORCS6Q96GS4 357 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 MFSD14AQ96MC6 490 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TMEM175Q9BSA9 504 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 MTMR12Q9C0I1 747 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 SPG21Q9NZD8 308 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 KANSL3Q9P2N6 904 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 SIX4Q9UIU6 781 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa10□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PSMA7O14818 248 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 FSCN2O14926 492 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PAK1Q13153 545 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 NFIL3Q16649 462 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 KYAT1Q16773 422 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 UPP1Q16831 310 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 KLHL40Q2TBA0 621 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 SPATA1Q5VX52 437 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 FEZF2Q8TBJ5 459 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CGRRF1Q99675 332 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 SCN1AP35498 2009 aa9.99□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 HIDE1A8MVS5 230 aa9.98□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 IL18RAPO95256 599 aa9.98□□□□□ -0.81
TMIGD1-202ENST00000538566 VNN1O95497 513 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms