RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GK5	Q6ZS86	529 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GPR142	Q7Z601	462 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FBXO27	Q8NI29	283 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM89A	Q96GI7	184 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GPATCH3	Q96I76	525 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LMF1	Q96S06	567 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CRBN	Q96SW2	442 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GP6	Q9HCN6	339 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CLDND1	Q9NY35	253 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SNTG2	Q9NY99	539 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GULP1	Q9UBP9	304 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CROT	Q9UKG9	612 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	DOCK1	Q14185	1865 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MYO10	Q9HD67	2058 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LCHN	A4D1U4	455 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIM75P	A6NK02	468 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CD247	P20963	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MAPK4	P31152	587 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CCL23	P55773	120 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF445	P59923	1031 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ARHGAP8	P85298	464 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PROSER3	Q2NL68	480 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SEZ6	Q53EL9	994 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	HOOK2	Q96ED9	719 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TESK2	Q96S53	571 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEM209	Q96SK2	561 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PORCN	Q9H237	461 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TMX1	Q9H3N1	280 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CD209	Q9NNX6	404 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	DLL4	Q9NR61	685 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PPT2	Q9UMR5	302 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SPTA1	P02549	2419 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SEPT4	O43236	478 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PGK1	P00558	417 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IMPDH2	P12268	514 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PLA2G2A	P14555	144 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PTPN21	Q16825	1174 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RPAIN	Q86UA6	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LILRB2	Q8N423	598 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MBD6	Q96DN6	1003 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC9A7	Q96T83	725 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MTA3	Q9BTC8	594 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GBP3	Q9H0R5	595 aa		3.34	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms