RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 WDR44Q5JSH3 913 aa28.57■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 SCARA3Q6AZY7 606 aa28.57■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 TNS4Q8IZW8 715 aa28.57■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 BADQ92934 168 aa28.57■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 NLRC4Q9NPP4 1024 aa28.57■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa28.57■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 COQ4Q9Y3A0 265 aa28.57■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 ALPK3Q96L96 1907 aa28.56■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 SCNN1GP51170 649 aa28.56■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 IMPG2Q9BZV3 1241 aa28.56■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 KCNE1P15382 129 aa28.55■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa28.55■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 HELQQ8TDG4 1101 aa28.55■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 MIOSQ9NXC5 875 aa28.55■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 THP07101 528 aa28.55■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 GLB1LQ6UWU2 654 aa28.55■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 PLCB1Q9NQ66 1216 aa28.55■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM161AQ9NX61 479 aa28.55■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 AGAP1Q9UPQ3 857 aa28.55■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa28.54■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 NOL4O94818 638 aa28.54■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 UPP2O95045 317 aa28.54■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 RAPGEF1Q13905 1077 aa28.54■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.163e-9■■■■□ 20.8
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NDUFS3-211ENST00000533507 SIX2Q9NPC8 291 aa28.54■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 APEX2Q9UBZ4 518 aa28.54■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 NT5C1BQ96P26 610 aa28.53■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa28.53■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 ITGA11Q9UKX5 1188 aa28.53■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 OFD1O75665 1012 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa28.52■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 FHOD1Q9Y613 1164 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 KRT9P35527 623 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 RBP5P82980 135 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 FPGSQ05932 587 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 ARID5BQ14865 1188 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGEF19Q8IW93 802 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 TATDN2Q93075 761 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 GANQ9H2C0 597 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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NDUFS3-211ENST00000533507 SLC38A7Q9NVC3 462 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 CEP72Q9P209 647 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 DNAJC12Q9UKB3 198 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 CAPN11Q9UMQ6 739 aa28.52■■■□□ 2.16
NDUFS3-211ENST00000533507 PFKMP08237 780 aa28.51■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 GSDMDP57764 484 aa28.51■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.51■■■□□ 2.154e-7■□□□□ 11.3
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGAP44Q17R89 818 aa28.51■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF699Q32M78 642 aa28.51■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 FIGNQ5HY92 759 aa28.51■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 IQCDQ96DY2 449 aa28.51■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 SPAG5Q96R06 1193 aa28.51■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 TTYH3Q9C0H2 523 aa28.51■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.5■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.5■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 IQCEQ6IPM2 695 aa28.5■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 CNGA4Q8IV77 575 aa28.5■■■□□ 2.15
NDUFS3-211ENST00000533507 URGCPQ8TCY9 931 aa28.5■■■□□ 2.15
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