RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 GPC5P78333 572 aa26.28■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 KCNN1Q92952 543 aa26.28■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 TCHPQ9BT92 498 aa26.28■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 SPTBN4Q9H254 2564 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 I3L4J1 428 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 SLC16A4O15374 487 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 TOM1L1O75674 476 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 PLS3P13797 630 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 ROR1Q01973 937 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 RABEP1Q15276 862 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 NPAS3Q8IXF0 933 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-211ENST00000531461 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa26.26■■□□□ 1.79
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ACER3-211ENST00000531461 SMTNP53814 917 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 STRN3Q13033 797 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 ZPBP2Q6X784 338 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 PJA1Q8NG27 643 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 GDE1Q9NZC3 331 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 WDR27A2RRH5 827 aa26.25■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 SFI1A8K8P3 1242 aa26.25■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 H7C4K7 107 aa26.25■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
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ACER3-211ENST00000531461 PRKCQQ04759 706 aa26.25■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.792e-7■■■■■ 40.8
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ACER3-211ENST00000531461 RHOP08100 348 aa26.24■■□□□ 1.79
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ACER3-211ENST00000531461 SLC10A6Q3KNW5 377 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 TPGS2Q68CL5 300 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 SUSD3Q96L08 255 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 OSBPL6Q9BZF3 934 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 MAFFQ9ULX9 164 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 NUB1Q9Y5A7 615 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 KANSL1LA0AUZ9 987 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 SLC26A4O43511 780 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 ECI2O75521 394 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 PTPN2P17706 415 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 ELF1P32519 619 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 MCL1Q07820 350 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 MCTP1Q6DN14 999 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 C1orf210Q8IVY1 113 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
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ACER3-211ENST00000531461 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 SLC5A9Q2M3M2 681 aa26.22■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 SLC44A4Q53GD3 710 aa26.22■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 ADSSL1Q8N142 457 aa26.22■■□□□ 1.79
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ACER3-211ENST00000531461 DCHS1Q96JQ0 3298 aa26.22■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 CLDN3O15551 220 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 PLA2G4BP0C869 781 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 GLULP15104 373 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 SCP2P22307 547 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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ACER3-211ENST00000531461 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 SPECC1Q5M775 1068 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 APPL2Q8NEU8 664 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 AK8Q96MA6 479 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-211ENST00000531461 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 PRRG1O14668 218 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 NCKAP1LP55160 1127 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.2■■□□□ 1.78
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ACER3-211ENST00000531461 ZNF280DQ6N043 979 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 DDX12PQ92771 950 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 TMX3Q96JJ7 454 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 KXD1Q9BQD3 176 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 INSL5Q9Y5Q6 135 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 PATJQ8NI35 1801 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 ZNF292O60281 2723 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 LMNAP02545 664 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 HARSP12081 509 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
ACER3-211ENST00000531461 LRPAP1P30533 357 aa26.19■■□□□ 1.78
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