RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 ADCY2Q08462 1091 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 NFYCQ13952 458 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf74Q86VG3 221 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 TPH2Q8IWU9 490 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 CPXCR1Q8N123 301 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 TEX19Q8NA77 164 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 DEF6Q9H4E7 631 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 ZMAT4Q9H898 229 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 VWA7Q9Y334 891 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 TNKSO95271 1327 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 PKD1L3Q7Z443 1732 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 OR14A2Q96R54 314 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 MTG2Q9H4K7 406 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 CD248Q9HCU0 757 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 TIMM44O43615 452 aa4.93□□□□□ -1.62
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