RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 EPC1Q9H2F5 836 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 LANCL2Q9NS86 450 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ABLIM3O94929 683 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SBK3P0C264 359 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 DDCP20711 480 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SLC6A2P23975 617 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ADKP55263 362 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 NHLH2Q02577 135 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PTH1RQ03431 593 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC55Q6ZSA7 311 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SPON1Q9HCB6 807 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PLCH2O75038 1416 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 MYO5CQ9NQX4 1742 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 IQSEC2Q5JU85 1478 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 NCOA1Q15788 1441 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 MARCH11A6NNE9 402 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 TOM1O60784 492 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 GPR32O75388 356 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ALDH1L1O75891 902 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 C6P13671 934 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 IL2RBP14784 551 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 KRT4P19013 534 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 CHN2P52757 468 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 IGBP1P78318 339 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 DACT2Q5SW24 774 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 TFAP2CQ92754 450 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 HOOK2Q96ED9 719 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 HS3ST4Q9Y661 456 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM24O15164 1050 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 AKAP10O43572 662 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SLPIP03973 132 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ELANEP08246 267 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PER3P56645 1201 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ANAPC15P60006 121 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 CDC42EP1Q00587 391 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 TUBA3CQ13748 450 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 GGT6Q6P531 493 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 MRGPREQ86SM8 312 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 CPT1CQ8TCG5 803 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PARPBPQ9NWS1 579 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 MRFAP1Q9Y605 127 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 KIF14Q15058 1648 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ABCA6Q8N139 1617 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SGTAO43765 313 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 PEX11BO96011 259 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 POU2F2P09086 479 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 RAP2AP10114 183 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 ATP5JP18859 108 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 RAB27AP51159 221 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 CTXN1P60606 82 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-209ENST00000522928 TLE1Q04724 770 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms