RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516443.1

RNU6-687P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 687, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-687P, Length 89 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-687P-201ENST00000516443 HLCSP50747 726 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 GEN1Q17RS7 908 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 FBXW10Q5XX13 1052 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 PMS2CLQ68D20 193 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZZZ3Q8IYH5 903 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 WDSUB1Q8N9V3 476 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 FANCBQ8NB91 859 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 KLHL6Q8WZ60 621 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 PGBD1Q96JS3 809 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 CCDC140Q96MF4 163 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SDF2L1Q9HCN8 221 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SCRT2Q9NQ03 307 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 RPS10P5Q9NQ39 176 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 KBTBD4Q9NVX7 518 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNRF3Q9ULT6 936 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 FBN3Q75N90 2809 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 A0A1B0GUV1 79 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 CCDC78A2IDD5 438 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 B5MCH6 92 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 GOLGA6L22H0YM25 854 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 PROM1O43490 865 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SRGNP10124 158 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ATP12AP54707 1039 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 APBA1Q02410 837 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 GHRHRQ02643 423 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF91Q05481 1191 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 XKR4Q5GH76 650 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 MED25Q71SY5 747 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZFP28Q8NHY6 868 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SSH1Q8WYL5 1049 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 MIB2Q96AX9 1013 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZFYVE19Q96K21 471 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 FERD3LQ96RJ6 166 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 RNF19AQ9NV58 838 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ASB1Q9Y576 335 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SLC12A7Q9Y666 1083 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 DSCR3O14972 297 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SOD2P04179 222 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 PKMP14618 531 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 KRT15P19012 456 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 DSCR9P59020 149 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 DUSP2Q05923 314 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 LPAL2Q16609 132 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 RTL10Q7L3V2 364 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SLC29A4Q7RTT9 530 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 GTSCR1Q86UQ5 136 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SLC34A3Q8N130 599 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SLC30A5Q8TAD4 765 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 LPIN2Q92539 896 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 EXOC2Q96KP1 924 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 PHF20Q9BVI0 1012 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 USP25Q9UHP3 1055 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZMYM3Q14202 1370 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-687P-201ENST00000516443 SCN5AQ14524 2016 aa0.28□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 DENND3A2RUS2 1198 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 KCNK3O14649 394 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 FOXP2O15409 715 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 FSBPO95073 299 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAM163BP0C2L3 166 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 RNF224P0DH78 156 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 NR2F6P10588 404 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 PGGT1BP53609 377 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 GFRA1P56159 465 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 DLX5P56178 289 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 SEC23AQ15436 765 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 GPR19Q15760 415 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 FIGNQ5HY92 759 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF484Q5JVG2 852 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 SPSB3Q6PJ21 355 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 PRSS57Q6UWY2 283 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 DSTYKQ6XUX3 929 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 OSTM1Q86WC4 334 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 MMP21Q8N119 569 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF398Q8TD17 642 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 C1orf159Q96HA4 380 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-687P-201ENST00000516443 ANO3Q9BYT9 981 aa0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms