RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 NCAPHQ15003 741 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 DBN1Q16643 649 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 BANK1Q8NDB2 785 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 PPTC7Q8NI37 304 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 C18orf8Q96DM3 657 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 KRT12Q99456 494 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 FMO2Q99518 471 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 PAK5Q9P286 719 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.2□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 M0R2N6 131 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 KRT37O76014 449 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 KRT38O76015 456 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CDK16Q00536 496 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CUL2Q13617 745 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 LINC00523Q86TU6 105 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 PALM2Q8IXS6 379 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 REPS2Q8NFH8 660 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 LRRC39Q96DD0 335 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 SNF8Q96H20 258 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 TMCO1Q9UM00 188 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 NFU1Q9UMS0 254 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 GIPC1O14908 333 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 APOEP02649 317 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 MYL3P08590 195 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ITGA4P13612 1032 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CES1P23141 567 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 BCAT1P54687 386 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 SLC12A2P55011 1212 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 HDAC4P56524 1084 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 STK4Q13043 487 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 MAP2K5Q13163 448 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 SNX1Q13596 522 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 FAM182BQ5T319 152 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ATG16L1Q676U5 607 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 EXD1Q8NHP7 514 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 WNK4Q96J92 1243 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 HSFY1Q96LI6 401 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 MMS19Q96T76 1030 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ZWILCHQ9H900 591 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 WHRNQ9P202 907 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CYTH3O43739 400 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 MTA2O94776 668 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ERCC3P19447 782 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ADCY8P40145 1251 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 NR2C2P49116 596 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 KCNQ4P56696 695 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 SP4Q02446 784 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 HHATQ5VTY9 493 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 STKLD1Q8NE28 680 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CALML6Q8TD86 181 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 SEPT8Q92599 483 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 STAMQ92783 540 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 CENPHQ9H3R5 247 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.19□□□□□ -1.42
POLK-215ENST00000514141 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms